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AI分析蛋白结构 动态追踪病毒变异-鬼魂之谜

AI分析蛋白结构 动态追踪病毒变异

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图:杭州杰毅生物开发了全自动高通量测序建库仪/网络图片  近日,浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台,利用阿里达摩院研发的AI算法,将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时,并能精准检测出病毒的变异情况。  「目前,主流检测手段为核酸检测方法。」达摩院算法专家顾斐博士指出,这项技术实际检测时间相对较长,而且只能检测到病毒基因的局部。由于病毒存在变异可能,因此核酸检测可能会出现假阴性、假阳性的情况。  把关后期防疫 提升确诊效率  不同于核酸检测,新的分析平台是对样本进行全基因组序列分析比对,能够有效防止漏检。此外,平台有效缩短了全基因测序的时间。「越往后走,越需要全基因检测,因为后期防疫的核心是防止病毒变异。」顾斐说。  顾斐介绍,在整个平台中,合作夥伴杰毅生物开发了全自动高通量测序建库仪,把常规人工需要12小时的工作缩短到2个小时。  「每次测序过程中产生的海量基因数据,则交由达摩院AI算法进行分析。」顾斐说,他们将病毒基因分析的速度由数小时缩短到半小时。同时,病毒序列拼接的速度由30分钟-1小时缩短到15-30分钟。  由此,AI算法可以在15-30分钟内预测病毒蛋白二级结构,从而帮助医护人员检测到病毒全貌,使得变异的病毒也能精准检测,大幅提升确诊效率。  记者 俞昼

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  • Brad Bukovsky
  • Brad Bukovsky

    (早报讯)国际货币基金组织重申,全球经济增速似乎正在触底回升,但同时也警告说,包括冠状病毒在内的风险将主导前景展望。 国际货币基金组织(IMF)在周三发布的监测报告中指出:“继去年明显放缓之后,预计全球经济活动将在2020年适度增强……货币和财政政策措施在支持经济活动方面发挥了作用,从而避免了进一步的下滑。” 彭博社报道,本周二十国集团财长和央行行长会议将在沙特阿拉伯首都利雅得举行。全球政策制定者正在努力应对中国疫情的影响,而贸易摩擦在去年刚刚降温。IMF制作监测报告以帮助二十国集团会议作决策。 “前景的下行风险继续占主导地位,”国际货币基金组织表示,冠状病毒的进一步传播或新的贸易紧张局势可能会破坏任何经济复苏。疫情“正在中断中国的经济活动,因为生产已经停止,受灾地区的流动性受到限制。” IMF在一个月前的世界经济展望报告中曾指出,全球经济可能会在2020年有所走强,但在贸易威胁和中东紧张局势的影响下,步伐将比先前预期的稍弱。该报告于1月20日发布,稍后不久,病毒起源地中国武汉就实施了封城举措。 该组织周三维持其1月份的预测不变,即全球经济增长将从2019年的2.9%回升至今年的3.3%。 国际货币基金组织在其监测报告中说,中国的短期前景在很大程度上取决于病毒遏制工作的成果,在这种破坏之后可能会出现一段强劲的追赶性增长期,就像在过去类似情形一样,例如之前的严重急性呼吸系统综合征(SARS,简称沙斯)。

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